卫所的坏处暂时不提，因为李卫设置的卫所虽然取其名，可实际上和当年朱元璋创建的卫所有所区别，换句话来说他所设置的卫所反而更像是后世的大集体农庄，同时又拥有一个准军事机构的民兵组织。
这是李卫在福建时曾经从公文中见到的新明的施政中演画而来的，新明由于它的特殊性，采取的和大明不同的施政方式，并且因为新明地广人稀，再加上不断扩展的原因，所以新明的移民都是全民为军的方式。
当然了，这个所谓的全民为军可不是所有人都是军人，而是所有移民都拥有自卫的武器和装备。在新明地区，无论男女，身上带着刀是非常常见的事，就连弓孥这样的管制武器在新明也是可以随身携带，甚至有人还可以直接携带火铳，只要他们的武器在官府做了备案，同时遵守使用要求的情况下，这一切都不违法。
这种政策，使得新明的移民拥有着自保能力，同时在聚集起来后又可以成为民兵组织，甚至起到部分军队的作用。
而现在李卫采取的也是类似的办法，并且以卫所的名义给予其权限，然后把人员安置在他们所选择的区域方向。此外，李卫还调动部分明军，包括一些西班牙治安队作为常驻，同时也用来训练这些移民。
他这么干的真正目的非常简单，那就是既然你们这些土人逃入吕宋腹地，那么大明也没必要花费巨大的人力和财力去特意围剿，毕竟吕宋一地太大，整个吕宋面积甚至比本土的普通一个省还要大，如此大的地盘用几万人去做这件事非但起不到什么效果，反而会劳民伤财。
李卫是个明白人，同样也是个聪明人。他知道要在短时间内彻底解决土人问题是绝对不可能的，何况那些土人也不会傻着站在那边等你杀上门去。
这是一个长期的过程，但只要从外围对吕宋腹地逐渐进行包围和封锁，那么藏在森林中的土人们随着时间的推移必然只有走向灭亡的一条路。也许只要过上几年或者更久些，随着森林中的各种天灾人祸发生，又或者大明的移民由外至内不断缩小包围，那么土人们就再也无法藏身和生存，而到那时候一切就水到渠成了。
李卫的这个方式看起来似乎比直接围杀要“文明”许多，但实际上这样做对于土人的解决却是异常彻底的。所以当李卫把这个建议告诉包德荣后，原本他以为包德荣会表示反对，谁想到平日里笑眯眯的包德荣在这时候却显出了让李卫都心惊的决断，冷笑着一口就同意了这个做法。
接下来的日子，随着李卫的“卫所”不断建立，吕宋土人的生存空间被不断进行压迫，土人们的日子也越来越难过。仅仅两年过后，逃入森林中的土人就因为瘟疫和天灾各种原因死亡近半，而剩余的土人们也活得异常艰难，甚至还组织了几次试图冲出包围的行动，但这些行动对于严阵以待的卫所来讲就是以卵击石。
五年后，当已经接任知府的李卫因为政绩卓越而被调回本土的时候，吕宋全岛的土人基本已经销声匿迹，仅仅只有最后不到千人的土人在森林深处苟活着，自此，吕宋的土人可以说已经被李卫和包德荣两人彻底解决，从而成为了历史。