11月中旬，在上海淞沪抗战失败已成定局，首都南京遭受巨大威胁的形势下，国民党中央和国民政府自料南京无法坚守，为坚持长期抗战，遂决定依照既定方针，作出了迁国民政府于重庆办公的重大决定。
11月12日，国民政府军事委员会委员长、行政院院长蒋介石与国民政府主席林森会商，决定迁都重庆。
16日，南京国民政府各机关除其最高长官留南京主持工作外，其余均自是日起离南京转武汉赴重庆。
17日，作为国家元首的国民政府主席林森率国民政府直属的文官、主计、参军三处的部分人员乘“永丰舰”启碇西上，从而揭开了抗战时期国民政府迁都重庆的序幕。
12月8日，中国国民党总裁、国民政府军事委员会委员长、国防最高会议主席蒋介石率军事委员会大本营由桂林飞抵重庆。
对于国民政府西迁，曹宁感到很难受。重生一世，历史还是原来的轨迹，没有因他的重生，而改变历史。
在11月30日，曹宁收到了戴笠给他的一份电报。
“值此民族危难时刻，每一个中国人，都是抗击侵略者的子弹。我希望你发挥你的才能，为国多作贡献。期望抗战胜利的那一天，我将十里外迎你回来。”
方杰的电报则是命令。
“从即日起，停止潜伏，命令你在战后开展活动，获取情报，为国出力。”
……
终于出水了！
出水后，曹宁最关心的是南京。
历史上，南京曾是千千万万中国人的痛。
淞沪会战末期，日军从杭州湾登陆，对上海进行翼侧包围。中国第三战区为避免上海作战部队两面受敌和为巩固首都，下令该地中国军队向南京外围既设阵地转移。日军于1937年11月12日占领上海，即乘胜西进，企图一举攻占南京，以迫使中国政府屈服。
日军攻占上海后，由于第10军并未遭到中国军队的坚强抗击，部队伤亡甚少，于是乘胜西进，不愿遵守参谋本部所规定的作战地域限制线，于11月15日夜决定“以军主力独立果断地向南京追击”。
上世的12月14日，日军山田支队占领了南京最后一个支撑点——幕府山。
天谷支队占领了扬州，切断了大运河。
第6师团一部进至下关。
国崎支队占领了浦口，切断了南京守军的一切退路。
麇集于燕子矶、下关沿江一带及八卦洲、江心洲中未撤至江北的大量中国官兵都成为日军的俘虏。
日“上海派遣军”司令官朝香宫鸠彦曾签署了一道嘱“阅后销毁”的机密命令，要所属部队“杀掉全部俘虏”。在占领南京城的前6个星期内，日军野蛮地屠杀了放下武器的俘虏数万人、平民20余万人，总数达30万人以上。
这一世，曹宁来了，他不想南京在他的目光下，再次出现那惨无人道的悲剧……