李世民功高盖主，麾下长孙无忌、尉迟恭、侯君集、张公谨、刘师立、公孙武达、独孤彦云、杜君绰、郑仁泰、李孟尝(一说为长孙无忌、尉迟恭、房玄龄、杜如晦、宇文士及、高士廉、侯君集、程知节、秦琼、段志玄、屈突通、张士贵)等文臣武将如云。
太子李建成开始猜忌提防李世民。
皇帝之下，太子第一，可以采取削职等各种措施封杀李世民。
秦王府幕僚属官人人忧虑，个个恐惧，不知所措。
房玄龄和长孙无忌商量说:"现在仇怨已经造成，一旦祸患暗发，岂只是秦王府不可收拾，实际上社稷的存亡都成问题。不如劝说秦王采取与周公平定管叔、蔡叔相似的行动，以便安定皇室与国家。存亡枢机，形势危急，就是现在了!"
长孙无忌说:"我有这一想法已经有很长时间了，只是不敢说出口。现在你说的这一席话，正好符合我的心愿。请让我代您禀告秦王。"
于是，长孙无忌进入内室告诉了李世民。
李世民把房玄龄召来商议此事，房玄龄说:"大王功盖天地，应当继承皇帝的大业。现在大王担心危机发生，正是上天在帮助大王啊。希望大王不要疑惑不定了。"
于是，房玄龄与杜如晦共同劝说李世民诛杀李建成、李元吉。
与此同时，李建成、李元吉见秦王府将领骁勇善战，采取利诱手段，暗中将一车金银器物赠送给左二副护军尉迟恭。
李建成亲自写了一封书信招引尉迟恭说:"希望得到您的屈驾眷顾，以便加深我们之间的布衣之交。"
尉迟恭立即把这件事禀报给了李世民。
李世民说:"明公对我的忠心就像山岳那样坚实牢靠，即使他赠送给您的金子堆积到了北斗星，我知道明公的忠心还是不会动摇的。他赠给您什么，您就接受什么，这又有什么值得猜疑的呢!况且，这样做能够了解他的阴谋，难道不是一个上好的计策吗!否则，祸事就将降临到您头上了。"
尉迟恭说:"我是编蓬为户、破瓮作窗人家的小民，遇到隋朝末年战乱不息、百姓流亡的时局，长期沦落在抗拒朝廷的境地里，罪大恶极，死有余辜。秦王赐给我再生的恩典，如今我又在秦王府注册为官，只应当以死报答秦王。我没有为太子殿下立过功，不敢凭空接受太子殿下如此丰厚的赏赐。倘若我私自与太子殿下交往，就是对秦王怀有二心，就是见利忘义的小人，殿下要这种人又有什么用呢!"
李建成大怒，便与他断绝了往来。
不久，李元吉指使勇士在夜间刺杀尉迟恭。
尉迟恭得知这一消息以后，将层层门户敞开，同时设置防御法阵，内紧外松。
自己安然躺着不动，刺客屡次来到他的院子，终究没敢进屋。
于是，李元吉向高祖诬陷尉迟恭，把他关进奉诏命特设的监狱里审问处治，准备将他杀掉，由于李世民再三请求保全他的生命，这才得以幸免。
李元吉又诬陷左一马军总管程知节，高祖将他外放为康州刺史。
程知节对李世民说:"大王的辅佐之臣快走光了，大王自身又怎么能够长久呢!我誓死不离开京城，希望大王及早将定下计策。"李元吉又用金银丝帛引诱右二护军段志玄，段志玄不肯从命。李建成对李元吉说:"在秦王府有智谋才略的人物中，值得畏惧的只有房玄龄和杜如晦。"李建成与李元吉又向高祖诬陷他们二人，使他们遭到斥逐。
李世民的心腹只剩下长孙无忌还留在秦王府中，他与他的舅舅雍州治中高士廉、右候车骑将军三水人侯君集以及尉迟恭等人，日以继夜地劝说世民诛杀李建成和李元吉，李世民犹豫不决。此外李世民可能还曾向灵州大都督李靖、行军总管李绩问计。
轩辕经天演算天机，梦里指点李世民。
轩辕经天说“六月初一丁巳日(626年6月29日)，太白金星将出现于天空正南方的午位， 这是"变天"的象征，你可以便宜从事，成就大业”李世民认为神仙托梦，肯定会成功。
于是，李世民收买在太子的东宫中担任率更丞职位的王晊，成为李世民在东宫的眼线。王晊悄悄告诉李世民:"太子对齐王说:'现在，你已经得到秦王骁勇的将领和精锐的士兵，拥有兵马数万之多了。我与秦王在昆明池为你饯行，让勇士在帐幕里将秦王杀死，上奏父皇时就说他暴病身亡，父皇应该不会不相信。我自当让人进言，逼父皇将国家大事交给我处理。尉迟恭等人已经落到了你的手中，应该将他们悉数坑杀，谁敢不服!'"
李世民将神仙托梦和王姓官员的话告诉了长孙无忌等人，长孙无忌等人劝李世民先发制人。
李世民叹息道:"骨肉相残，是古往今来的大罪恶。我当然知道祸事即将来临，但我打算在祸事发生以后，再举义讨伐他们，这不也是可以的吗!"
尉迟恭说:"既然有神仙托梦，说明大王是上天所授。祸事马上就要发生，大王却仍旧神态自若，毫不担忧。即使大王把自己看轻，又怎么对得起宗庙社稷呢!如果大王不肯采用我的主张，我就准备逃身荒野草泽，不能留在大王身边，拱手任人宰割!"
长孙无忌说:"如果大王不肯听从尉迟恭的主张，事情肯定要失败了。尉迟恭等人肯定不会再追随大王，我也应当跟着他们离开大王，不能够再事奉大王了!"
李世民说:"神仙之梦，当不得真。"
尉迟恭说:"如今大王处理事情犹豫不定，这是不明智的;面临危难，不能决断，这是不果敢的。况且，大王平时畜养的八百多名大成真人，现在都已经进入宫中，他们穿好盔甲，手握兵器，起事的形势已经形成，大王怎么能够制止得住呢!"
李世民征求秦王府幕僚们的意见，大家都说:"齐王凶恶乖张，是终究不愿意事奉自己的兄长的。近来听说护军薛实曾经对齐王说:'大王的名字，合起来可以成为一个唐字，大王终究是要主宰大唐社稷。'齐王欢喜地说:'只要能够除去秦王，夺取东宫太子之位就易如反掌了。'他与太子谋划作乱还没有成功，就已经有了夺取太子之位的心思。作乱的心思没有满足，又有什么事情做不出来呢!假使这两个人如愿以偿了，恐怕天下就不再归大唐所有。以大王的贤能，捉拿这两个人就如拾取地上的草芥一般容易，怎么能够为了信守匹夫的节操，而忘了国家社稷的大事呢!"
李世民仍然没有决断，大家又问道:"大王认为舜是什么样的人呢?"李世民答道:"是圣人。" 大家说:"假如舜帝在疏通水井的时候没有躲过父亲与弟弟在上面填土的毒手，便化为井中的泥土了;假如他在涂饰粮仓的时候没有逃过父亲和弟弟在下面放火的毒手，便化为粮仓上的灰烬了，怎么还能够让自己恩泽遍及天下，法度流传后世呢!所以，舜帝在遭到父亲用小棒笞打的时候便忍受了，而在遭到大棍笞打的时候便逃走了，这大概是因为舜帝心里所想的是大事啊。"
这时阎立言奉轩辕经天之命前来占卜。阎立言口不能言，然而算无遗策，特意为李世民算卦。天地交泰，上卦。
轩辕经天又连续几晚托梦。